一、自我评价：企业按照《认定办法》中的认定条件进行自我评价，符合条件的，在“高新技术企业认定管理工作网”上进行注册登记。
二、注册登记：企业登录“高新技术企业认定管理工作网”，按要求填写注册登记表，并通过网络系统上传，认定小组办公室及时完成企业身份确认并授权企业提交的用户名和密码。此环节在1个工作日内完成。
三、准备并提交材料：企业委托经备案的中介机构对研究开发费用及近一个会计年度高新技术产品（服务）收入进行专项审计，登录“高新技术企业认定管理工作网”，提交以下材料：
（1）企业营业执照副本、税务登记证书（复印件）；
（2）经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、利润及利润分配表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）；
（3）《高新技术企业认定申请书》；
（4）技术创新活动证明材料，包括知识产权证书、独占许可协议、生产批文，新产品或新技术证明（查新）材料、产品质量检验报告，省级（含计划单列市）以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料；
（5）经备案的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计报告；企业需提交经技术市场管理办公室认定登记的技术合同等能够证明高新技术服务收入的证明材料。
四、区县组织申报：企业网上提交材料后，将书面材料一式五份报送到企业注册所在地的区县科委或中关村各所在园区管委会，由各区县科委和所在园区管委会进行辅导服务后统一报送高新技术企业认定小组办公室。区县科委和园区管委会收到企业有效申请材料后应在3个工作日内送交到认定办公室。
五、专家评审：认定办公室在收到申请材料后，按技术领域从专家库中随机选择不少于5名相关专家，并将企业申请材料分发给所选专家。专家按照规定的评审标准提出评价意见，填写《高新技术企业认定专家评价表》和《高新技术企业认定专家组综合评价表》，报送给认定办公室。专家评审工作在5个工作日内完成。
六、组织认定：认定办公室每两周召开一次认定会，由认定小组初步确定高新技术企业认定名单，会后由认定小组各成员单位在10个工作日内完成会签。
七、公示及颁发证书：经认定的高新技术企业，在科委网和“高新技术企业认定管理工作网”上公示15个工作日。公示有异议的，由认定小组对有关问题进行查实处理，属实的取消高新技术企业资格。公示无异议的，填写审批备案汇总表，报管理领导小组办公室备案后，在科委网站和“高新技术企业认定管理工作网”上公告认定结果，并由认定办公室在5个工作日内颁发“高新技术企业证书”。
